Zemus era un malvagio seleniano che intendeva eliminare la razza umana dal pianeta azzurro per far posto alla propria. Dotato di poteri straordinari, era stato sigillato per anni nelle profondità della luna, ma era riuscito a manovrare Golbez perché continuasse la sua opera.
Dopo aver ripreso il controllo di sé, Golbez affrontò Zemus assieme al seleniano Fusoya, e la loro forza combinata riuscì a sconfiggerlo. Sfortunatamente, l'anima di Zemus sopravvisse, e il suo odio diede vita a un orrendo mostro: Zeromus.
Questo corpo può anche sparire... Ma il mio spirito non morirà MAI! —Zemus
Lo scontro con Zemus è completamente automatico, e non è nemmeno affrontato dal gruppo principale, bensì da Golbez e Fusoya. Zemus non compirà alcuna azione durante la sequenza, mentre i due personaggi useranno potenti attacchi magici ad ogni turno: Golbez userà, nell'ordine, Fuocoga, Buferaga e Tuonaga, mentre Fusoya userà Lentezza, Blocco e Sancta.
Dopo che Fusoya avrà usato l'ultima magia, questi dirà "È quasi fatta! Potere a Meteo!", al che Golbez risponderà "Benissimo!" e il duo userà la potente magia Bimeteo, che causerà la bellezza di 99999 danni al boss, sconfiggendolo all'istante.
