L'anima di Exdeath era una proiezione dello spirito di Exdeath, che agiva come estensione del potere dello stregone. Apparve all'interno del castello dei sigilli dopo il ricongiungimento del pianeta R, attaccando chiunque entrasse nel palazzo con la sua spada mortale.
Simile all'originale ma con un pattern d'attacco diverso, l'anima di Exdeath attaccherà il party con, oltre ai normali attacchi fisici, diverse magie mortali: Oblio, Morte (che funzioneranno pochissime volte, data la potenza magica nulla del nemico) e la temibile tecnica Spada mortale, che ucciderà senza scampo un personaggio (proteggersi quindi con un fiocco). Usare Sancta ed armi sacre è la migliore strategia, oltre a preoccuparsi di resuscitare costantemente i personaggi con Rinascita o Miracolo.
Lo schema di colori di questo nemico è servito da ispirazione per il primo costume alternativo di Exdeath, in Dissidia Final Fantasy.
Durante la battaglia con l'anima di Exdeath, la musica non cambia: al posto del tema di battaglia è riprodotto Sealed Away, il tema del castello dei sigilli.
